El Escudo de Andújar es medio partido y cortado. En el primer cuartel, de gules (rojo) un castillo de oro, almenado de tres almenas, mazonado de sable(negro) y aclarado de azur (azul). En el segundo cuartel, aparece un águila de sinople (verde). En campo de azur, un puente con tres arcos, de plata sobre ondas de azur y plata, en medio de las cuales figura un pez de plata y dos llaves de oro puestas en aspa conforman el tercer cuartel. Bordura general de plata con cuatro leones rampantes de gules, coronados de oro. Contorno oval y timbre de corona real.

Fernando III concedió a Andújar el tercero de los cuarteles descritos, debido a la importancia que el puente y la ciudad tuvieron en la conquista cristiana del Valle y las Campiñas Béticas. El pez y las ondas simbolizan al Guadalquivir y las llaves por ser guarda de la frontera. La primera y segunda partición fueron otorgadas por Enrique IV, que después acrecentó en 1467 con la bordura de las reales armas de León y el título de “Muy Nombre y Muy Leal ”. Años antes,concretamente en 1446, el rey JuaII le había concedido el título de ciudad.El castillo obedece al reino de Castilla, en tanto que el águila representa la generosidad de Andújar.

Autorizada mediante Decreto 27/1994, de 8 de febrero, de la Consejería de Gobernación de la Junta de Andalucía (BOJA nº. 34, de 18 de marzo), queda organizada de la siguiente forma:

Bandera de paño rectangular, de proporciones 2/3, dividido horizontalmente en tres franjas de igual anchura, de color carmesí la central y blancas las otras dos; en el centro, un esturión blanco sobrepuesto a dos llaves cruzadas en aspa de color amarillo.